Jika sampel terkontaminasi mikroorganisme selain mikobakteria, gunakan larutan dekontaminasi yang sesuai, seperti larutan asetilsistein natrium hidroksida atau larutan natrium laurilsulfat. Inokulasi 0,2 mL sampel ke masing-masing 2 media padat yang sesuai (media Lӧwenstein-Jensen dan media Middlebrook 7H10 yang sesuai) secara triplo. Inokulasi 0,5 mL sampel ke dalam media cair yang sesuai secara triplo.
Inkubasi semua media pada 37° selama 56 hari. Tetapkan fertilitas media dengan menggunakan galur Mycobacterium sp. (misalnya BCG) dan jika perlu gunakan bahan penetral yang sesuai. Jika mikroorganisme kontaminan tumbuh selama 8 hari pertama inkubasi, ulangi uji dan lakukan uji sterilitas bakteriologis secara bersamaan. Sediaan memenuhi syarat jika pada akhir waktu inkubasi tidak ada pertumbuhan mikobakteri.